Vybrané výstupy za rok 2024

V rámci provozu a využívání naší velké výzkumné infrastruktury BBMRI.cz vznikla celá řada unikátních publikací a užitných vzorů. Zde uvádíme výběr některých z nich, relevantní pro daný rok:

Výběr operátorských publikací (operátorské publikace jsou ty, které se popisují nebo zlepšují fungování infrastruktury):

Engels C, Kern J, Dudová Z, et al. The sample locator: A federated search tool for biosamples and associated data in Europe using HL7 FHIR. Comput Biol Med. 2024 Sep;180:108941. doi: 10.1016/j.compbiomed.2024.108941. (IF2023: 7.0; Q1)
Ryska A, Sapino A, Landolfi S, et al. Glyoxal acid-free (GAF) histological fixative is a suitable alternative to formalin: results from an open-label comparative non-inferiority study. Virchows Arch. 2024 Aug;485(2):213-222. doi: 10.1007/s00428-023-03692-6. (IF2023: 3.4; Q2)

Výběr uživatelských publikací (uživatelské publikace jsou ty, které použijí vzorky/data z biobanky k vlastním projektům a výzkumu). Níže je vybráno 10 publikací:

Kasikova L, Rakova J, Hensler M, et al. Tertiary lymphoid structures and B cells determine clinically relevant T cell phenotypes in ovarian cancer. Nat Commun. 2024 Mar 21;15(1):2528. doi: 10.1038/s41467-024-46873-w. (IF2023: 14.700, Q1)
Soukup J, Manethova M, Stejskal V, et al. Hand2 Immunohistochemistry in the Diagnosis of Paragangliomas and Other Neuroendocrine Neoplasms. Endocr Pathol. 2024 Mar;35(1):14-24. doi: 10.1007/s12022-024-09803-6. (IF2023: 11.3; Q1)
Lanickova T, Hensler M, Kasikova L, et al. Chemotherapy Drives Tertiary Lymphoid Structures That Correlate with ICI-Responsive TCF1+CD8+ T Cells in Metastatic Ovarian Cancer. Clin Cancer Res. 2025 Jan 6;31(1):164-180. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1594. (IF2023: 10.400; Q1)
Flídrová M, Hájková N, Hojný J, et al. Unraveling the Molecular Landscape of Uterine Tumor Resembling Ovarian Sex Cord Tumor: Insights From A Clinicopathological, Morphologic, Immunohistochemical, and Molecular Analysis of 35 Cases. Mod Pathol. 2024 Sep 10;37(12):100611. doi: 10.1016/j.modpat.2024.100611. (IF2023: 7.1; Q1)
Rudzanová B, Thon V, Vespalcová H, et al. Altered Transcriptome Response in PBMCs of Czech Adults Linked to Multiple PFAS Exposure: B Cell Development as a Target of PFAS Immunotoxicity. Environ. Sci. Technol. 2024;58(1):90–98. doi: 10.1021/acs.est.3c05109. (IF2023: 10.9; Q1)
Pálešová N, Řiháčková K, Kuta J, et al. Internal Flames: Metal(loid) Exposure Linked to Alteration of the Lipid Profile in Czech Male Firefighters (CELSPAC-FIREexpo Study). Environ Sci Technol Lett. 2024 Jun 12;11(7):679-686. doi: 10.1021/acs.estlett.4c00272. (IF2023: 10.9; Q1)
Rudzanova B, Thon V, Vespalcova H, et al. Gene expression patterns associated with PFOA exposure in Czech young men and women. Environ Int. 2024 Aug;190:108879. doi: 10.1016/j.envint.2024.108879. (IF2023: 10.3; Q1)
Benesova A, De Santis S, Polivkova V, et al. Unstable major molecular response as a trigger for next generation sequencing-based BCR::ABL1 mutation testing in chronic myeloid leukemia. Am J Hematol. 2024 Apr;99(4):759-762. doi: 10.1002/ajh.27232. (IF2023: 10.1; Q1)
Bartosik M, Moranova L, Izadi N, et al. Advanced technologies towards improved HPV diagnostics. J Med Virol. 2024 Feb;96(2):e29409. doi: 10.1002/jmv.29409. (IF2023: 6.8; Q1)
Michálková R, Šafanda A, Hájková N, et al. The Molecular Landscape of 227 Adult Granulosa Cell Tumors of the Ovary: Insights into the Progression from Primary to Recurrence. Lab Invest. 2024 Nov 29;105(3):102201. doi: 10.1016/j.labinv.2024.102201. (IF2023: 5.1; Q1)