Projekt CanSERV - akcelerátor poznatků v personalizované onkologii
CanSERV - Špičkové služby v rámci pokročilé personalizované medicíny - Pro vědce zaměřené na rakovinu ZDARMA - prodlouženo do 25.5.2023
Aktuality
Zajímavosti
-
CPP Phenogenomics Conference 2019
The CCP Phenogenomics Conference is organized by the Czech Centre for Phenogenomics hosted at the Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences. CCP is an active member of the Infrafrontier and IMPC consortia. For more information about CCP please visit: https://www.phenogenomics.cz/ The focus of of this year’s conference is on the following topics: Effects of long non‐coding RNA; Metabolism models; Metabolism phenotyping technologies. The conference is primarily intended for current and potential CCP users (scientific community from both the Czech Republic and abroad). The meeting will take place on 12 ‐ 13 September 2019 in the newly built European Centre of Excellence in biomedicine and biotechnology „BIOCEV“ in Vestec (near Prague). More information about the event is available at: https://www.ccp‐conference.cz/ Keynote speaker: Svante Pääbo, Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Leipzig Invited speakers: * Jan-Wilhelm Kornfeld, Denmark * Günter Meister, Germany * Petr Svoboda, Czech Republic * Jan Rozman, Germany * Raffaele Teperino, Germany * Thomas Werner, USA * Je Kyung Seong, Korea * Eleonora Leucci, Belgium
-
ESA připravuje s českou podporou „stíhače komet“
Výborem pro Vědecký program Evropské kosmické agentury (ESA) byla dne 19. června 2019 vybrána první tzv. „rychlá mise“ Vědeckého programu ESA s názvem „Comet Interceptor“. Mise, která bude složena z 3 sond, má za cíl prozkoumat dosud neobjevenou kometu či jiný interstelární objekt, např. podobný objektu „Oumuamua“, který právě vstupuje do vnitřní sluneční soustavy. Comet Interceptor bude po startu „zaparkován“ v libračním bodě L2, který je vzdálen od Země 1,5 mil. km, kde bude vyčkávat na nasměrování ke svému dosud neznámému cíli. Po svém vyslání mise provede průlet kolem svého cíle, před čímž se 3 sondy oddělí a budou tak moci provést simultánní pozorování z většího množství bodů v okolí komety či jiného objektu. Z těchto dat bude moci být následně vytvořen 3D profil tělesa, které obsahuje materiál z počátků sluneční soustavy. Comet Interceptor je „rychlou“ misí, misí nové třídy „F“. „Rychlá“ v tomto případě odkazuje na dobu, za kterou musí být mise připravena – od výběru po letovou připravenost nesmí přesáhnout dobu 8 let. Comet Interceptor má startovat v roce 2028 jako spolupasažér mise střední třídy ARIEL (Atmospheric Remote-sensing Infrared Exoplanet Large-survey), která se zaměří na výzkum exoplanet. Cíl výzkumu nemusí být v žádném případě známý už v průběhu přípravy mise. Comet Interceptor může být připraven vyčkávat ve vesmíru na vhodný objekt k průzkumu. Očekává se, že mise bude ukončena do 5 let od startu. Díky vyčkávání v kosmickém prostoru bude poté moci Come Interceptor prozkoumat kometu anebo jiný objekt, který vnitřní sluneční soustavu navštěvuje poprvé. Takovéto objekty byly v minulosti objeveny pouze několik měsíců či let předtím, než se přiblížily Slunci na nejkratší vzdálenost, což je nedostatečný čas k vývoji a vynesení průzkumné sondy. Na přípravě návrhu mise Come Interceptor se podíleli vědci z Matematicko-fyzikální fakulty Univerzity Karlovy a Ústavu fyziky atmosféry AV ČR, kteří by se měli zapojit také do přípravy vědeckého vybavení mise. Vědecký program ESA aktuálně nabízí řadu dalších příležitostí pro české vědce a podniky.
-
Konsorcium CESSDA ERIC bude mít již 20 členů
Bergen, 13. června 2019 – V Norsku – hostitelském státu statutárního sídla konsorcia CESSDA ERIC (Council of European Social Science Data Archives) – se uskutečnilo 5. zasedání valného shromáždění této právnické osoby. CESSDA ERIC je evropskou sociálněvědní výzkumnou infrastrukturou, jejímž cílem je provozovat sociálněvědní datové archivy, propagovat výzkumné výsledky dosažené na poli společenských věd a podporovat sociálněvědní výzkum na mezinárodní úrovni. V průběhu zasedání byla diskutována zejména budoucí strategie rozvoje činností CESSDA ERIC. Za nové členy konsorcia byly přijaty Řecko a Severní Makedonie. CESSDA tak bude sdružovat 20 členských států, přičemž vstup dalších členů do CESSDA ERIC se očekává i v budoucnu. CESSDA i nadále úspěšně spolupracuje s iniciativou EOSC (European Open Science Cloud) – v listopadu roku 2018 získala zastoupení ve Výkonné radě EOSC a počátkem roku 2019 se stala koordinátorem tzv. SSHOC projektu (Social Sciences and Humanities Open Cloud). V roce 2018 se CESSDA zapojila také do Aliance pro sociální a humanitní vědy (EASSH). CESSDA přijala roku 2017 právní rámec evropského konsorcia výzkumné infrastruktury (ERIC), přičemž ČR byla jedním ze zakládajících členů tohoto konsorcia. Zapojení ČR do CESSDA ERIC je zabezpečováno Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy prostřednictvím velké výzkumné infrastruktury CSDA (Český sociálněvědní datový archiv), jejímž koordinátorem je Sociologický ústav AV ČR, v. v. i. CSDA je českým národním centrem datových služeb v sociálních vědách, jež shromažďuje, zpracovává a ukládá datové soubory z výzkumných projektů a zpřístupňuje je pro účely jejich budoucího využití ve výzkumu a při výuce na vysokých školách.
-
ČR požádala o členství v konsorciu DARIAH ERIC
Praha, 14. června 2019 – Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy oficiálně požádalo o vstup ČR do konsorcia evropské výzkumné infrastruktury DARIAH ERIC (Digital Research Infrastructure for the Arts and Humanities). Českým národním koordinátorem výzkumných aktivit rozvíjených v rámci DARIAH ERIC se stane velká výzkumná infrastruktura LINDAT/CLARIAH-CZ, jejíž hostitelskou institucí je Univerzita Karlova. Hlavním posláním DARIAH ERIC je podpora a rozvoj digitálního výzkumu v oblasti umění a humanitních věd a rozvoj vzdělávacích činností v daných vědních oborech. DARIAH ERIC poskytuje digitální nástroje pro výzkum a sdílí výzkumná data v režimu politiky otevřeného přístupu. Tím zvyšuje jejich dostupnost a využitelnost a vytváří podmínky pro mezinárodní srovnávací výzkum. V současnosti sdružuje DARIAH ERIC již 17 evropských států, přičemž jeho statutární sídlo se nachází v Paříži ve Francii. ČR se bude na výzkumných činnostech DARIAH ERIC podílet prostřednictvím projektu velké výzkumné infrastruktury LINDAT/CLARIAH-CZ (Digitální výzkumná infrastruktura pro jazykové technologie, umění a humanitní vědy), jejímž koordinátorem je Univerzita Karlova. LINDAT/CLARIAH-CZ sdružuje celkem 11 výzkumných institucí ČR působících v humanitních a uměleckých oborech, jakými jsou jazykověda, historie, historická bibliografie, kultura, věda o kultuře, historie umění, filozofie, filmová kultura, vizuální umění, muzikologie, historie hudby, etnologie, folklór, archeologie a další interdisciplinární vědní obory. Nad rámec toho je LINDAT/CLARIAH-CZ také společným distribuovaným národním uzlem ČR v konsorciu evropské výzkumné infrastruktury CLARIN ERIC (Common Language Resources and Technology Infrastructure). V Evropě již bylo ustaveno 20 konsorcií evropských výzkumných infrastruktur s právním rámcem ERIC. ČR je aktuálně členským státem 12 z nich.
-
Slavnostní ceremoniál umístění EuroHPC petascale superpočítače do ČR
Praha, 13. června 2019 – Na Ministerstvu školství, mládeže a tělovýchovy se za přítomnosti zástupce generálního ředitele Evropské komise pro komunikační sítě, obsah a technologie Khalila Rouhany uskutečnila slavnostní ceremonie umístění tzv. „EuroHPC petascale superpočítače“ v IT4Innovations národním superpočítačovém centru na Vysoké škole báňské – Technické univerzitě v Ostravě. Delegaci Evropské komise uvítal místopředseda vlády ČR pro ekonomiku a ministr průmyslu a obchodu Karel Havlíček a pozitivně ocenil úspěch IT4Innovations v celoevropské soutěži o hostitelství jednoho z nejvýkonnějších výpočetních systémů v EU: „Vysokorychlostní počítání představuje jednu z klíčových technologických oblastí pro vědu a průmysl. Hraje i stěžejní roli v budování jednotného digitálního trhu a digitální ekonomiky v EU obecně. Evropa na daném poli bohužel ve srovnání s ostatními světovými makro-regiony prozatím zaostává. Jsem proto nesmírně rád, že se ČR tak úspěšně zapojuje do společné technologické iniciativy EuroHPC a zásadním způsobem přispívá k rozvoji superpočítačových technologií v Evropě a ve světě.“ Celková pořizovací investice EuroHPC petascale systému činí 15 mil. EUR, z čehož 35 % nákladů bude financováno Evropskou komisí. Zbývající část nákladů bude uhrazena za využití prostředků Evropských strukturálních a investičních fondů prostřednictvím Operačního programu Výzkum, vývoj a vzdělávání (OP VVV). „Financování EuroHPC petascale systému na IT4Innovations bude probíhat za využití nástrojů politiky soudržnosti EU, komplementárně k financování provozních nákladů IT4Innovations z dotačního titulu velkých výzkumných infrastruktur. Velice mě těší, že nad rámec této synergie jsme dosáhli rovněž synergie s prostředky rámcového programu Horizontu 2020. IT4Innovations se tímto stává příkladem dobré praxe čerpání národních a evropských rozpočtových zdrojů.“, uvedl Pavel Doleček, náměstek pro řízení sekce vysokého školství, vědy a výzkumu Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy. Projekt jednoho z nejvýkonnějších evropských superpočítačů „IT4Innovations centrum pro evropskou vědu a průmysl“, který uspěl v konkurenci Lucemburska, Portugalska, Slovinska a Bulharska jako vůbec nejlépe hodnocený, představil při ceremoniálního aktu Vít Vondrák, ředitel IT4Innovations národního superpočítačového centra: „IT4Innovations etabluje ČR na poli superpočítačových technologií. Kromě úspěchu v podobě získání hostitelství EuroHPC petascale systému se zapojujeme i do projektu pořízení ještě výkonnějšího EuroHPC pre-exascale systému, jako člen Finskem koordinovaného LUMI konsorcia. Jsme velice poctěni, že superpočítače na IT4Innovations sehrají takto důležitou roli v realizaci stěžejních vědeckých experimentů a napomohou i průmyslovému sektoru při aplikaci vědeckých poznatků v praxi“. Tzv. „LUMI“ (Large Unified Modern Infrastructure) konsorcium, tvořené koordinujícím Finskem a dále také Belgií, ČR, Dánskem, Estonskem, Nizozemím, Norskem, Polskem, Švédskem a Švýcarskem, pořídí v roce 2020 EuroHPC pre-exascale systém, jehož instalace proběhne ve Finském Kajaani. ČR se díky příspěvku Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy ve výši 5 mil. EUR bude podílet na úhradě jeho investičních a provozních nákladů podílem 2,5 %. V průběhu návštěvy v ČR byla Khalilu Rouhanovi představena rovněž další česká pracoviště zaměřující se na rozvoj a využití informačních technologií ve výzkumu, vývoji a inovacích, a to Výzkumné centrum informatiky a Český institut informatiky, robotiky a kybernetiky. Tato výzkumná a vývojová pracoviště Českého vysokého učení technického v Praze představují špičková centra umělé inteligence, a to nejen v českém, ale i v evropském měřítku. Společně s IT4Innovations a s dalšími e-infrastrukturami CESNET a CERIT Scientific Cloud, sdruženými v rámci konsorcia e-INFRA CZ, představují nejvýznamnější kapacity ČR pro výzkum, vývoj a inovace na poli informačních a komunikačních technologií. Intenzivně jsou poté zapojeny i do věcně příslušných evropských a celosvětových oborových sítí.
-
IT4Innovations bude hostit EuroHPC petascale superpočítačový systém
Praha, 7. června 2019 – IT4Innovations národní superpočítačové centrum situované na Vysoké škole báňské – Technické univerzitě v Ostravě uspělo v celoevropské soutěži o hostitelství tzv. „EuroHPC petascale superpočítačového systému“, který bude v EU vybudován v rámci implementace společné technologické iniciativy EuroHPC. Výsledky soutěže o umístění a kofinancování systému byly orgány společného podniku EuroHPC vyhlášeny při příležitosti 7. zasedání jeho správní rady. Z celkem 5 předložených návrhů získal český projekt „IT4Innovations centrum pro evropskou vědu a průmysl“ od hodnotící komise ze 100 možných 95 bodů, díky čemuž se umístil na 1. místě. O pozici hostujících subjektů EuroHPC petascale superpočítačových systémů se ucházelo rovněž Lucembursko, Portugalsko, Slovinsko a Bulharsko. Nakonec bude, rovněž s ohledem na jejich kvalitu, pravděpodobně podpořeno všech 5 předložených návrhů. Místopředseda Evropské komise pro jednotný digitální trh Andrus Ansip v této souvislosti uvedl: „Tato nová střediska umožní vědcům a výzkumným pracovníkům přístup ke špičkovým superpočítačům světové úrovně. Díky nim bude možné zpracovávat údaje přímo v EU, nikoli v superpočítačových střediscích mimo její území. Pro Evropu to znamená zásadní krok k dosažení nové úrovně výpočetní kapacity. Pomůže nám to výrazněji pokročit v rozvoji technologií zaměřených na budoucnost, jako je internet věcí, umělá inteligence, robotika a analýza dat.“ Pořizovaný EuroHPC petascale superpočítačový systém se svými parametry zařadí mezi nevýkonnější superpočítače v Evropě. Aktuálně by zaujal 21. místo na světě a 6. místo v Evropě. V době jeho instalace v příštím roce se očekává, že bude náležet mezi 50 nejvýkonnějších superpočítačů na světě a v Evropě bude zaujímat místo v první desítce. Systém je navržený tak, aby uceleně pokryl uživatelské požadavky při řešení komplexních vědeckých i průmyslových problémů zahrnujících klasické numerické simulace i rozsáhlé datové analýzy nebo využití umělé inteligence. Investiční náklady na pořízení systému dosáhnou celkové výše 15 mil. EUR, z čehož 35 % nákladů, tzn. 5,25 mil. EUR, bude uhrazeno Evropskou komisí. Zbývající náklady budou financovány za využití zdrojů Evropských strukturálních a investičních fondů prostřednictvím Operačního programu Výzkum, vývoj a vzdělávání (OP VVV). Pořízení systému se očekává v roce 2020, přičemž jeho provozní náklady v letech 2020 až 2025 budou činit 14 mil. EUR. IT4Innovations národní superpočítačové centrum souběžně uspělo i v soutěži o EuroHPC pre-exascale superpočítačový systém, a to jako člen tzv. „LUMI“ (Large Unified Modern Infrastructure) konsorcia tvořeného koordinujícím Finskem a Belgií, ČR, Dánskem, Estonskem, Nizozemím, Norskem, Polskem, Švédskem a Švýcarskem. Systém bude koncem roku 2020 nainstalován ve Finském Kajaani a stane se jedním z nejvýkonnějších v Evropě i ve světě. Celkové náklady na jeho pořízení a provoz dosáhnou výše 200 mil. EUR. Příspěvek ČR, hrazený Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy, bude činit 2,5 %, tzn. 5 mil. EUR. Pořízení EuroHPC petascale superpočítačového systému na IT4Innovations a zapojení IT4Innovations do LUMI konsorcia za účelem pořízení EuroHPC pre-exascale superpočítačového systému představuje významný příspěvek ČR k úspěšné implementaci společné technologické iniciativy EuroHPC a obecně k posilování konkurenceschopnosti EU v oblasti digitálních technologií. České a mezinárodní vědecké i průmyslové komunitě tyto úspěchy umožní využívat pro jejich aktivity výzkumu, vývoje a inovací jedny z vůbec nejvýkonnějších výpočetních kapacit. Slavnostní oznámení o hostitelství EuroHPC petascale superpočítačového systému na IT4Innovations národním superpočítačovém centru proběhne dne 13. června 2019 při příležitosti návštěvy zástupce generálního ředitele Evropské komise pro komunikační sítě, obsah a technologie Khalila Rouhany v ČR.
-
Konference HPCSE představila novinky nejen z oblasti supercomputingu
(Ostrava, 27. května 2019) IT4Innovations národní superpočítačové centrum uspořádalo ve dnech 20. až 23. května 2019 čtvrtý ročník konference High Performance Computing in Science and Engineering (HPCSE) na Soláni v Beskydech. Téměř 100 odborníků a studentů z různých koutů světa si na konferenci HPCSE vyměňovalo zkušenosti z oblasti superpočítačových technologií a řady dalších vědních disciplín, které je využívají nebo přispívají k jejich rozvoji. Během čtyř dní zazněly více než tři desítky přednášek mapující aktuální výsledky výzkumu. Účastníci tak měli výjimečnou příležitost vyměnit si zkušenosti a informace především z oblasti aplikované matematiky, numerických metod, vysoce výkonných výpočtů, datových analýz a vizualizace vědeckých dat. Mezi přednášejícími byla zvučná jména z řad českých, ale i zahraničních odborníků. Jakub Kurzak z University of Tennessee ve Spojených státech amerických prezentoval software SLATE (Software for Linear Algebra Targeting Exascale) pro superpočítače úrovně exascale Ministerstva energetiky USA, přičemž vedoucím softwarové vývojové skupiny je Jack Dongarra, nestor HPC a světa superpočítačů. Tématu exascale a vývoji softwarů se věnuje i Dominik Göddeke z německé Univerzity ve Stuttgartu. O supercomputingu pro řešení komplexních inženýrských problémů, se zaměřením na turbomechanické stroje, hovořil Garth Wells z Univerzity Cambridge. Andrea Bartolini z italské Boloňské univerzity přednesl příspěvek shrnující několikaletý výzkum inovativních technologií pro tzv. zelené a inteligentní superpočítače budoucnosti. Lubomír Říha z IT4Innovations seznámil účastníky s novým přístupem načítání databázových souborů obsahující data nestrukturovaných sítí, pro které IT4Innovations vyvíjí vysoce paralelní řešiče. „Konferenci HPCSE hodnotím jako velmi příjemnou a produktivní. Navázal jsem několik nových kontaktů, a dokonce dostal i pár nápadů. Rád bych zmínil některé aspekty konference. Zprvu jsem si myslel, že příspěvky budou detailně zaměřené na vysoce výkonné výpočty, ve skutečnosti však pokrývaly široké spektrum zajímavých oblastí, od základního výzkumu po průmyslový design a renderování filmů. Technická kvalita byla vysoká a velmi užitečná byly krátká úvodní představení autorů posterů, která bych uvítal i na jiných konferencích,“ uvedl Ben T. Cox, vedoucí výzkumné skupiny „Biomedical Ultrasound Group“ na University College London, který se zabývá numerickými simulacemi šíření akustických vln, jež se využívají v seismologii a medicíně. Fotogalerii naleznete na stránkách konference HPCSE. Sborník vybraných příspěvků letošní konference HPCSE bude publikován v sérii „Lecture Notes in Computer Science“ (Springer). Vydání z předešlého ročníku je ke stažení na https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-319-97136-0
-
Náměstek Pavel Doleček jednal s předsedkyní Rady CERN
Praha, 27. května 2019 – Náměstek pro řízení sekce vysokého školství, vědy a výzkumu Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy Pavel Doleček přivítal v Praze předsedkyni Rady Evropské organizace pro jaderný výzkum (CERN) Ursulu Bassler. Během společného jednání byla vedena zejména debata o volbě budoucího generálního ředitele CERN a o naplňování opatření ke zvýšení přínosů členství ČR v této mezinárodní organizaci výzkumu a vývoje, jež se i tak nachází na mimořádně vysoké úrovni. Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy aktuálně jedná např. o zvýšení počtu českých studentů v CERN a o podpoře využívání technologií CERN ze strany českých start-upů v rámci ustavovaného inkubačního centra CERN BIC v ČR. Během své návštěvy v ČR bude Ursula Bassler dále jednat i s českou výzkumnou komunitou, a to o přípravě aktualizace Evropské strategie částicové fyziky, která určí směřování tohoto vědního oboru do budoucna. Ursula Bassler je předsedkyní Rady CERN ode dne 1. ledna 2019. Působí také jako zástupkyně ředitele francouzského Národního institutu jaderné a částicové fyziky (IN2P3-CNRS). V minulosti působila v řadě dalších výzkumných infrastruktur aktivních v oblastech částicové a jaderné fyziky (v německém DESY či ve Fermilab v USA) a ve významných poradních orgánech (např. Poradní panel k fyzice vysokých energií Ministerstva energetiky USA). CERN je mezinárodní organizací výzkumu a vývoje se sídlem ve švýcarské Ženevě, jež provozuje vůbec největší laboratoř pro výzkum fyziky částic na světě. Základním pilířem výzkumné infrastruktury CERN je urychlovač LHC, na němž jsou rozmístěné jednotlivé experimenty, resp. detektory, a to ATLAS, CMS, ALICE, LHCb a další menší detektory. ČR, resp. Československo, je členským státem CERN od roku 1991.